如何使用dnaman输出多序列比对图 阅读框架是什么?怎么解释?

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如何使用dnaman输出多序列比对图

阅读框架是什么?怎么解释?

阅读框架是什么?怎么解释?

  阅读框架(Reading frame)是指RNA或DNA中,一组连续且不重复的3核苷酸密码子。每一条mRNA共有3种可能的阅读框架,而双股的DNA则每股各3种,共6种阅读框架。同一序列具有多种阅读框架的现象使重叠基因(overlapping genes)可能存在,已知常见于某些细菌与病毒。至于人类细胞中则较少见。  若是一个核糖体进行转译时改变了阅读框架,将导致转译转移(Translational frameshift)的发生。而如果一段DNA序列被插入了一个新的核苷酸,那么会造成框架转移突变(frameshift mutation)。

DNAMAN为什么总是提醒无响应?

可能是中了病毒,或者系统文件缺失,或者系统盘占用空间过多……此类问题如果频繁……建议重装系统~

我的世界是一款什么游戏?

我正在考核期,麻烦点赞谢谢。我的世界,一款高自由度的沙盒游戏。有生存模式,需要收集各种资源让自己活下去。有创造模式,无限资源,可以研究好多东西。除了这两个之外,还有冒险模式,只有一条命,死了的话存档回自动删除,还有我的世界里有各种各样的模组,还有各种地图,可以下载游玩地图。

sequencher怎么看酶切位点?

首先要知道基因序列,然后很多软件(譬如DNAMAN)都可以分析其中酶切位点

gc含量和tm值的公式?

引物长度,碱基组成,引物使用缓冲的离子强度有关。长度为25mer以下的引物,Tm计算公式为:Tm4℃(G C) 2℃(A T)对于更长的寡聚核苷酸,Tm计算公式为:Tm81.5 16.6xLog10[Na ] 0.41(%GC)–600/size公式中,Size引物长度。用Primer5.0,DNAMAN,DNASTAR都可以算,我从来没自己算过。

怎样对DNA多重序列比对结果分析?

你所做的工作应该是寻找某个物种中的某一个基因在其它物种中的同源基因(ortholog)然后再做进化树那种吧。
进行多序列比对有许多软件都可以做到,DNAman我用的比较多的是alignment而不是multisequencealignment。
给你推荐一些软件,一个是clustalx,一个是MEGA,这两个软件都可以进行蛋白多序列比对,而后者我认为更强大些,还可以进行进化树分析。
把你所有从NCBI上找到的CDS导入到软件中(一般做同源分析都是用蛋白质序列)。
然后用软件进行比对就可以了,结果可以输出为多种形式,比如fasta或者其它格式,软件用法我这里也不多讲了,必须看专用的手册。如果还有不明白就发信息给我